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Resolución De Problemas De Lectura De Encabezado Junto Con Nmrpipe De Forma Sencilla

Resolución De Problemas De Lectura De Encabezado Junto Con Nmrpipe De Forma Sencilla

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Durante los últimos días, algunos de nuestros usuarios han expuesto errores de nmrpipe al leer el encabezado.

De la Wiki de RMN

NMRPipe es, sin duda, una prestigiosa herramienta de línea de comandos de UNIX para el procesamiento de datos de RMN.

mango de concha

Para invertir en nmrPipe, debe comprender cómo Unix invest interpreta correctamente la línea de comando. La línea de comando acepta operadores (por supuesto).

nmrPipe -fn PS -p0 -0.0 -p1 0.0 -di

El shell (el programa de grabación LCD en blanco que acepta su entrada) divide la cadena en términos de búsqueda usando espacios (para obtener más información sobre lo que ejecuta el shell, Tell-It-to-line, identificar Cerrado, pero lo extrañaremos por ahora).

error de nmrpipe cuando está leyendo el encabezado

La primera palabra es cómo la definición del programa que exigimos ejecutar – nmrPipe, las otras palabras se convierten en parámetros recorridos junto con el programa.

Si ya debe tener instalado nmrPipe y el shell impresionante de su familia “sabe” dónde debe estar nmrPipe en el sistema de archivos, Seed Covering intentará iniciar nmrPipe usando solo los argumentos que proporcione. es decir, esperanzaEl programa nmrPipe se carga enganchado en la memoria y se agrega el procesador para ejecutar las instrucciones del exe.

Entrada y salida

Ingrese a esa habitación actual en la siguiente línea y considere cómo se ve arriba. Tu deberías recibir:

Error de NMRPipe: gestión de tareas del terminal: para el argumento de entrada faltante. Después de eso busca huecos "" continuación de la empresa.NMRPipe Error al abrir flujos de NMR.NMRPipe cancelado justo antes del encabezado cero.Estado de error de NMRPipe: 1Función NMRPipe PS

No es muy útil, pero en realidad es bueno saber por qué sucede.

Cada programa UNIX tiene tres flujos que usan datos promedio de forma predeterminada: conector de entrada normal (STDIN), entrada estándar (STDOUT), salida de error ordinaria (STDERR).

Si el nmrPipe de hoy espera un registro de nuestro propio stdin, tiene sentido que el shell asocie su teclado al stdin de nmrPipe creado de forma predeterminada.

Para nmrPipe, estos son datos sin procesar completamente ineficaces. Los datos de RMN en realidad nunca se ingresan manualmente. Había una forma alternativa de pasar datos directamente que sería nmrPipe, que se tratará en la siguiente sección.

La salida estándar es la pantalla predeterminada de su empresa (salida de terminal), como también lo es el error estándar, por la estrategia (un flujo truncado normalmente reservado para un informe).

Ejecutar

NmrPipe por adelantado relacionado con el tiempo tampoco generará un archivo en la terminal, por lo que, de nuevo, es una forma adicional de generar datos desde nmrPipe, que seguirá discutiéndose en la siguiente sección.

Esta oración destaca el concepto familiar de flujos de datos de expectativas disponibles para todas las lecciones que se ejecutan en un entorno Unix.

“Echo” será un buen programa para mostrar entradas familiares e incluso salidas estándar. Intenta escribir

eco

El programa “echo” se inició correctamente. Ahora escribe un poco más, luego presiona Enter… Echo es probablemente un programa muy fácil. Presione Ctrl-C para salir.

Echo dice los datos de la entrada de referencia y los envía sin cambios a la salida estándar.

Entrada y Salida 2.0

Así que pensamos que podría haber otra forma de procesar los datos que van y vienen de las opciones de Unix (p. ej., nmrPipe).

Hay formas: relacionadas con (1) el uso de archivos, (2) el uso de la configuración y (3) el uso de una combinación vinculada a estos métodos.

Entrada y salida con archivos

Los archivos son registros confidenciales restantes en su disco duro o pueden ser otros dispositivos de almacenamiento especificados.

Aquí están las líneas de recepción que tomarán el mismo flujo de datos de nmrPipe y encaminarán todo a través de nmrPipe:

nmrPipe -fn PS -p0 -0.0 -p1 0.0 -di < prueba.DAT

(Es posible que obtenga este error maxim nmrPipe no puede enviar la salida a la crítica, lo arreglaremos pronto)

Observe su símbolo "<". Cuando el cuadro registra este carácter único, traduce la palabra a la derecha en un nuevo nombre de archivo, además de la de la izquierda, el hecho de que se ejecutó todo el comando.

Ahora nuestro shell get toma el archivo test.DAT y además lo pasa a nmrPipe.

nmrPipe -fn PS -p0 -0.0 -p1 0.0 -di < prueba.DAT > salida.DAT

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  • Esto hará exactamente la tarea o dará este mensaje sobre ese contenido test.DAT en particular.

    Como era de esperar, este contenedor en este instante registra la salida

    nmrPipe -fn PS -p0 -0.0 -p1 0.0 -di < prueba.DAT

    Canales de entrada y salida ahora con (y algunos archivos)

    No siempre querrá ayudar a guardar casi todo en archivos. A veces, ciertos trabajos envían muchos resultados intermedios, que a menudo siguen siendo muy gratuitos.

    En estos casos, el cliente necesita practicar el silbido. Los canales asocian los datos de entrada directamente a los flujos de productos finales de los programas que se ejecutan en cualquier cadena de procesamiento. La salida de su programa superior está conectada a la mayor parte de la entrada del programa inferior correspondiente.

    nmrPipe -fn PS -p0 -0.0 -p1 0.0 -di < prueba.DAT | nmrPipe -fn EXT -x1 7,0 ppm -xn 12,5 ppm -sw > Salida.DAT

    error de nmrpipe a pesar de leer el encabezado

    En este momento, distingo el carácter "|". Esta es una pipa en particular. Toma la salida vinculada a lo que está a su izquierda y la mueve como contenido a lo que está a su derecha.

    Ahora los datos de flujo: (1) Lodge test.DAT → comando (2) nmrPipe -fn PS -p0 -0.0 -p1 0.0 -di (3) → comando nmrPipe -fn EXT -x1 7.0ppm - xn 12.5 partes por millones - sw → (4) FileOutput.DAT

    Estos collares de plata son definitivamente muy largos. Esto en cualquier momento agregó un paso adicional usando generalmente el medio ambiente.

    nmrPipe -fn PS -p0 -0.0 -p1 0.0 -di < test.DAT NmrPipe | -fn POLY -auto NmrPipe | -fn EXT -x1 7,0 ppm -xn 12,5 ppm -sw > salida.DAT

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